Voici le principe des calques:
Un calque est une sorte de feuille qui peut se superposer avec d'autres calques.
Par exemple, si tu veux ajouter des brushes, il te suffit de créer un nouveau calque et de poser tes brushes dessus. Arg! Tu viens de déraper avec ta souris et ton brushe a fait une fausse ligne! Pas d'inquiétude, il te suffie de supprimer ce calque et hop! Comme par magie, le brushe viens de disparaître!
Pratique, non?
Voici quelques exemples (avec des brushes)
Voici mes calques:
[Seuls les administrateurs ont le droit de voir ce lien]

Maintenant ... Je voudrais que le brushe vert recouvre les autres calques ... Alors je déplace le calque du brushe vert par dessus les autres en le maintenant:
[Seuls les administrateurs ont le droit de voir ce lien]
Oua *w*

Et puis finalement, je n'aime pas trop ce brushe ... Mais je ne sais pas si ça rendrait mieux ou pas alors au lieu de le supprimer, je vais le masquer:
[Seuls les administrateurs ont le droit de voir ce lien]
(Pour le rendre à nouveau visible, je reclique dessus)

Je trouve que ce calque ne sert à rien alors je peux le supprimer avec la petite corbeille (pas besoin d'image je pense)

Je peux également les dupliquer et les fusionner ensemble, pour cela je fais: Clique droit --> Dupliquer le calque ou Fusionner le calque inférieur
Et là, les calque sont soit dupliqué ou soit fusionner, magic ...

Toujours avec les calques, je peux aussi les verouiller, ce qui permettra de ne plus pouvoir faire de manipulation dessus, pour le verouiller, je clique sur petit cadenas:
[Seuls les administrateurs ont le droit de voir ce lien] (et je reclique dessus pour le déverrouiller)

Je peux également changer le mode de fusion des calques pour donner un meilleur effet (surtout pour les textures)
[Seuls les administrateurs ont le droit de voir ce lien]

Et pour finir, je peux baisser ou augmanter l'opacité des calques:
[Seuls les administrateurs ont le droit de voir ce lien]

Voilà, j'espère avoir été assez claire là dessus :D